Die herausragende Lage des Wendelsteins zog nicht nur Touristen und Bergfreunde an. Bereits 1883 wurde im Wendelsteinhaus auf 1.724 m eine meteorologische Station eingerichtet. Luftdruck, Temperatur, Luftfeuchtigkeit, Stärke und Richtung des Windes, Form und Zug der Wolken wurden dreimal täglich notiert und im Nachhinein veröffentlicht.

1961/62 wurde das Dienstgebäude am 1.838 m hohen Gipfel erbaut und daraufhin mit synoptischen Aufzeichnungen und Meldungen begonnen. Den wetterfesten Übergang zur Sternwarte gibt es seit 1997. 

Die Wetterstation am Wendelsteingipfel ist eine von ca. 80 hauptamtlichen Stationen des Deutschen Wetterdienstes und ist jeweils in Schichtdiensten rund um die Uhr besetzt. Hauptaufgabe ist die Wetterbeobachtung, d. h. Bestimmung und Aufzeichnung folgender Parameter: Sichtweite, Windrichtung und Geschwindigkeit, Temperatur und Taupunkt - Niederschlagsmengen (inkl. Schneehöhen), Sonnenscheindauer u. Luftdruckmessungen sowie relative Feuchte, Bewölkungsverhältnisse, Wetterzustand (Regen, Gewitter etc.). Diese Daten werden zur globalen Analyse und Wetterprognose in die Zentrale des Deutschen Wetterdienstes nach Offenbach / Main gesendet. 

Außerdem befasst sich das Stationspersonal mit der Wartung und Überwachung der Gerätschaften, Verwaltungsarbeiten und Klimadatenerfassung.